本文摘要:摘 要:運(yùn)用SRAP分子標(biāo)記研究了山東省3個(gè)鉤齒溲疏居群的遺傳多樣性,結(jié)果顯示,用15對(duì)引物共檢測(cè)到244個(gè)位點(diǎn),其中多態(tài)位點(diǎn)167個(gè),物種水平多態(tài)位點(diǎn)百分率(PPL) 68.44%,Neis基因多樣性指數(shù)(H) 0.2158,Shannons信息指數(shù)(I)0.3282,數(shù)據(jù)表明鉤齒溲疏有較高的
摘 要:運(yùn)用SRAP分子標(biāo)記研究了山東省3個(gè)鉤齒溲疏居群的遺傳多樣性,結(jié)果顯示,用15對(duì)引物共檢測(cè)到244個(gè)位點(diǎn),其中多態(tài)位點(diǎn)167個(gè),物種水平多態(tài)位點(diǎn)百分率(PPL) 68.44%,Nei’s基因多樣性指數(shù)(H) 0.2158,Shannon’s信息指數(shù)(I)0.3282,數(shù)據(jù)表明鉤齒溲疏有較高的遺傳多樣性水平;居群間遺傳分化系數(shù)(Gst)為0.3685,表明居群間遺傳變異只占36.85%,遠(yuǎn)低于居群內(nèi)遺傳分化;在居群水平上,以嶗山鉤齒溲疏居群的遺傳多樣性最高,徂徠山最低;居群間遺傳一致度(GI)和遺傳距離(GD)變化范圍分別為0.8350~0.8884和0.1184~0.1803,居群間的遺傳距離與地理位置間沒(méi)有直接相關(guān)性。
關(guān)鍵詞:鉤齒溲疏;SRAP;遺傳多樣性
鉤齒溲疏(Deutzia baroniana)屬于虎耳草科(Saxifragaceae)溲疏屬(Deutzia),落葉灌木,分布于遼寧、河北、山西、陜西、山東、江蘇和河南[1]。鉤齒溲疏花朵潔白,繁密而素凈,花期長(zhǎng),且盛開(kāi)于初夏,正值少花時(shí)節(jié),宜叢植于山坡、草坪、路旁或林緣,也是巖石園、花籬的常用材料,花枝可作插花觀賞。鉤齒溲疏適應(yīng)性非常強(qiáng),常生于溝谷、林緣或巖石縫中,耐旱、耐瘠薄、抗寒,對(duì)于干旱、少雨的北方城市綠化極為適宜,是北方十分難得的園林綠化、美化材料。此外,鉤齒溲疏根、葉、果還可藥用。因此,鉤齒溲疏具有很高的觀賞和經(jīng)濟(jì)價(jià)值,是一種值得開(kāi)發(fā)的野生植物資源,值得大力引種并繁育推廣。
一個(gè)物種之所以能繁殖存活,并且適應(yīng)環(huán)境改變,根本原因在于其遺傳多樣性[2]。北大核心期刊居群對(duì)環(huán)境的適應(yīng)能力在一定程度上由居群的遺傳多樣性水平制約著,因此通過(guò)研究其遺傳多樣性水平可預(yù)測(cè)這個(gè)居群未來(lái)的發(fā)展趨勢(shì)[3]。而目前尚未見(jiàn)從DNA水平上對(duì)鉤齒溲疏的遺傳多樣性進(jìn)行分析的研究和報(bào)道。
相關(guān)序列擴(kuò)增多態(tài)性(Sequence-related amplified polymorphism,SRAP)是通過(guò)設(shè)計(jì)獨(dú)特的引物對(duì)基因ORFs(Open reading frames)的特定區(qū)域進(jìn)行擴(kuò)增并分析的標(biāo)記手段[4]。目前已成功應(yīng)用于作物遺傳多樣性評(píng)價(jià)、指紋圖譜構(gòu)建、重要性狀的標(biāo)記以及相關(guān)基因的克隆等方面[5~8]。本研究對(duì)山東省內(nèi)21份鉤齒溲疏進(jìn)行SRAP遺傳多樣性分析,旨在研究其遺傳多樣性水平,為開(kāi)發(fā)利用鉤齒溲疏野生資源、在景觀應(yīng)用中選育優(yōu)良品種提供分子水平的依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
試驗(yàn)樣品于2012~2013年采自山東嶗山、泰山和徂徠山,共21份樣品(表1)。同一居群相鄰植株采樣間距30 m以上,采取新鮮幼嫩葉片放入密封袋中,用變色硅膠干燥。記錄所采樣品的小地名、海拔、經(jīng)緯度并編號(hào)。
1.2 DNA提取
選用改良的CTAB法[9]提取樣品總DNA,用0.8%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA質(zhì)量,用紫外分光光度計(jì)檢測(cè)DNA濃度后用ddH2O稀釋至50 ng/μL,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.3 SRAP-PCR反應(yīng)體系和程序
SRAP引物設(shè)計(jì)參照Li等[4],13個(gè)正向引物和19個(gè)反向引物共組成247對(duì)引物組合,由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成。從中篩選出15對(duì)擴(kuò)增條帶數(shù)量多、清晰、穩(wěn)定的引物組合(表2)用于正式擴(kuò)增。
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